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Continuous target-specific mutagenesis and rapid gene evolution by diversity-generating retroelements in Escherichia coli

यह शोध पत्र प्रदर्शित करता है कि विविधता-उत्पन्न करने वाले रेट्रोजेनेटिक तत्वों (DGRs) को *Escherichia coli* में इंजीनियर किया जा सकता है और क्षैतिज जीन स्थानांतरण (horizontal gene transfer) के साथ जोड़ा जा सकता है ताकि लक्षित जीनों के निरंतर, पुनरावृत्तिपूर्ण और स्थिति-विशिष्ट उत्परिवर्तन (mutagenesis) के लिए एक सरल, प्रोग्राम करने योग्य प्रणाली बनाई जा सके, जो जैव-प्रौद्योगिकी अनुप्रयोगों के लिए पाइरोलिल-tRNA सिंथेटेस जैसे प्रोटीनों के तीव्र विकास को सक्षम बनाती है।

Liu, Y., Gu, Y., Agam, G., Rehm, F., Spinck, M., Chin, J., Holliger, P.2026-07-22✓ Author reviewed
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Pharmacologically regulated bioorthogonal stabilization domain for regulation of CAR T cells

यह अध्ययन मानव एस्ट्रोजन रिसेप्टर-आधारित डिग्रेन डोमेन का उपयोग करके CAR T सेल कार्य को नियंत्रित करने के लिए एक नैदानिक रूप से संगत, प्रतिवर्ती रणनीति प्रस्तुत करता है जो 4-हाइड्रॉक्सीटैमोक्सीफेन के माध्यम से सटीक फार्माकोलॉजिकल ON-स्विच सक्रियण और एफडीए-अनुमोदित PROTAC ARV-471 के माध्यम से OFF-स्विच क्षरण को सक्षम बनाता है, जिससे सेलुलर इम्यूनोथेरेपी की सुरक्षा और सटीकता बढ़ती है।

Rihtar, E., Fink, T., Belak, M., Udvanc, R., Jerala, R.2026-07-16
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Domain Insertion Improves the Precision of a CRISPR Adenine Base Editor

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि TadA8e एडेनिन बेस एडिटर के अवशेष L68 पर एक भारी, अक्रिय प्रोटीन डोमेन को सम्मिलित करने से एक सटीक संस्करण निर्मित होता है जिसमें संकुचित संपादन विंडो, कम ऑफ-टारगेट प्रभाव और अंतर्निहित प्रतिदीप्ति ट्रैकिंग क्षमताएं होती हैं।

Müller, M. M., Southern, N. T., Niopek, D.2026-07-10
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LUstiGE, Light responsive Ustilago maydis Gene Expression: Optogenetic control of morphogenesis and pathogenesis in the corn fungal pathogen Ustilago maydis

यह अध्ययन मक्का के कवक रोगजनक *Ustilago maydis* में नीली-प्रकाश-प्रेरित ऑप्टोजेनेटिक स्विच स्थापित करता है ताकि जीन अभिव्यक्ति पर सटीक, प्रतिवर्ती और गतिशील नियंत्रण प्राप्त किया जा सके, जिससे रोगजनक-मेजबान अंतःक्रियाओं और जैव-प्रौद्योगिकी अनुप्रयोगों के उन्नत अनुसंधान हेतु कोशिका आकृति विज्ञान, तंतुमय आक्रमण और ट्यूमर निर्माण का हेरफेर संभव हो सके।

Tang, K., Müller, M. D., Hüsemann, L., Zuo, W., Rybecky, A., Heucken, N., Postma, J., van Wijlick, L., Doehlemann, G. (…)2026-07-09
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Barcoded-Plasmid DNA library construction for recording cell lineage trees enabled by a Scalable and modular Biofoundry-based Automated Robotic Pipeline

यह शोध पत्र CyBio FeliX प्लेटफॉर्म और SPRI-आधारित चुंबकीय बीड तकनीक का उपयोग करते हुए एक स्केलेबल, मॉड्यूलर और स्वचालित रोबोटिक पाइपलाइन प्रस्तुत करता है जो उच्च गुणवत्ता वाले प्लास्मिड डीएनए को कुशलतापूर्वक शुद्ध करने के लिए है, जिसने सफलतापूर्वक स्तनधारी कोशिका वंश अनुरेखण (mammalian cell lineage tracing) के लिए 528-प्लास्मिड लेंटिविरल लाइब्रेरी के निर्माण और सत्यापन को सक्षम बनाया है।

Tassinari, E., Ives, L., Hawkins, E., Annese, D., Fonseca, S., Lan, Y., Haerty, W., Wojtowicz, E., Grandellis, C.2026-07-08
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Reprogramming a Protein Ligase for Genetic Code Expansion

लाइसिल-tRNA सिंथेटेस के एंटीकोडन-बाइंडिंग डोमेन को प्रोटीन लाइगेज EpmA पर ग्राफ्ट करके, शोधकर्ताओं ने एक काइमेरिक एंजाइम (chEpmA) इंजीनियर किया है जो एक प्रोटीन लाइगेज को एक बहुमुखी अमीनोएसिल-tRNA सिंथेटेस के रूप में सफलतापूर्वक पुनर्गठित करता है, जो जेनेटिक कोड के विस्तार के लिए {बीटा}-अमीनो एसिड और विभिन्न पोस्ट-ट्रांसलेशनल संशोधनों सहित विविध गैर-कैनोनिकल सबस्ट्रेट्स के साथ tRNAs को चार्ज करने में सक्षम है।

Gallo, G., Sieber, A., Hellwig, M., Fuerst, M. J. L. J., Lassak, J. M.2026-07-08
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TaxoFormer: Hierarchical Transformer for Predicting the Full Taxonomic Lineage of Protein Sequences

यह शोध पत्र TaxoFormer को प्रस्तुत करता है, जो एक पदानुक्रमित (hierarchical) ट्रांसफॉर्मर आर्किटेक्चर है जो विशाल NCBI फाइलोजेनेटिक ट्री (phylogenetic tree) को हानिरहित रूप से (losslessly) प्रदर्शित करने के लिए एक संरचित टोकनाइज़ेशन योजना का उपयोग करता है, जिससे एक सरल जनरेटिव मॉडल 188 मिलियन अनुक्रमों (sequences) से पूर्ण प्रोटीन टैक्सोनोमिक वंशों की सटीक भविष्यवाणी करने और सार्थक फाइलोजेनेटिक निरूपण सीखने में सक्षम होता है।

Parsa, M., Azimian, K., Wei, K. Y.2026-06-09
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Complex-phase stochastic modeling of mitochondrial heteroplasmy

यह शोधपत्र एक नवीन जटिल-चरण (complex-phase) स्टोकेस्टिक मॉडल प्रस्तुत करता है जो माइटोकॉन्ड्रियल हेटरोप्लाज्मी को एक सम्मिश्र संख्या (complex number) के रूप में निरूपित करता है ताकि कॉपी संख्या और उत्परिवर्तित भार (mutant load) को एक साथ ट्रैक किया जा सके, जिससे चयन, आनुवंशिक विचलन (genetic drift) और ऊतक प्रवासन गतिशीलता को एकीकृत करके रोग के जोखिम का एक मात्रात्मक, व्यक्तिगत मूल्यांकन सक्षम हो सके।

Nurbaev, S., Pocheshkhova, E.2026-06-09
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Vibe Coding Specificity Foundation Models

यह शोध पत्र स्पेसिफिसिटी फाउंडेशन मॉडल्स (SFMs) को प्रस्तुत करता है, जो एक भौतिकी-व्युत्पन्न न्यूरल आर्किटेक्चर है जो छह विविध आणविक पहचान डोमेन को संरचनात्मक डेटा के बिना बाइंडिंग विशिष्टता की भविष्यवाणी करने के लिए एक एकल, अत्यधिक डेटा-कुशल ढांचे में एकीकृत करता है, यह प्रदर्शित करते हुए कि डोमेन विशेषज्ञ प्राकृतिक भाषा-निर्देशित "वाइब कोडिंग" का उपयोग करके इन मॉडलों को सफलतापूर्वक विकसित और मान्य कर सकते हैं।

Reddy, S. T.2026-06-04
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Generating E. coli 0.5 controlled by a half-sized genome

यह शोध पत्र एक ऐसे प्लेटफॉर्म को प्रस्तुत करता है जो एक IDE और RTE को एकीकृत करके एक न्यूनतम 2.3-Mb *E. coli* जीनोम के निर्माण, डिबगिंग और स्थिरीकरण के लिए उपयोग किया जाता है—जो वाइल्डटाइप के आकार से आधा से भी कम है—जिसमें होस्ट जीनोम को सेल-फ्री असेंबल किए गए गेस्ट जीनोम द्वारा प्रतिस्थापित किया गया है, जिससे AI-डिज़ाइन किए गए जीनोमों को भौतिक रूप से साकार करने की क्षमता को आगे बढ़ाया गया है।

Mukai, T., Ohishi, A., Hagiuda, E., Shimamoto, K., Yoshida, K., Su'etsugu, M.2026-06-03